La Sociedad Científica Mexicana de Ecología A.C. (SCME) se fundó el 2 de septiembre de 2005 en su sede actual, la Academia Mexicana de Ciencias. El acta de la Asamblea general Constitutiva de la SCME se firmó el 2 de septiembre de 2005, en la Ciudad de México.
La Asamblea fue convocada por el Dr. Juan Nuñez Farfán, nombrándose como Presidente de la Asamblea al Dr. Héctor Arita Watanabe y como Secretario al Dr. Miguel Equihua Zamora.
Una vez constituida la SCME, el primer Consejo Directivo quedó conformado como sigue:
Presidente: Juan Núñez Farfán
Vicepresidente: Arturo Flores Martínez
Secretario: Pedro Luis Valverde Padilla
Secretario: Néstor Mariano Bonigo
Tesorero: Zenón Cano Santana
Consejo Directivo
2020-2022
- Presidente: Dra. Ireri Suazo Ortuño, UMSNH
- Vicepresidente: Dr. Miguel Martínez Ramos, IIES-UNAM
- Tesorera: Dra. Mayra Gavito Pardo, IIES-UNAM
- Secretaria: Dra. Ek del Val de Gortari, IIES-UNAM
- Vocal: Dra. Julieta Benítez Maldivo. IIES-UNAM
- Vocal: Dr. Miguel Equihua Zamora, Instituto de Ecología, A.C.
- Vocal: Dra Karina Mariela Figueroa Mora. UMSNH
- Secretaria Ejecutiva: América Baleón Sepúlveda
Presidencias regionales 2020-2022
| Dra. Angela Andrea Camargo Sanabria | Noroeste | Universidad Autónoma de Chihuahua |
| M.C. Arturo H. González González | Noreste | Museo del Desierto, Coahuila |
| Dr. Joel David Flores Rivas | Mesa Central | IPICyT, San Luis Potosí |
| Dr. Aramis Olivos Ortiz | Occidente | Universidad de Colima |
| Dr. Arturo Flores Martínez | Centro | IPN |
| Dra. Martha Bonilla Moheno | Oriente | INECOL, Veracruz |
| Dr. Quetzalcóatl Orozco Ramírez | Sureste | Instituto de Geografía, UNAM, Oaxaca |
| Dra. Mariana Álvarez Añorve | Península de Yucatán | ENES Mérida, UNAM |
Consejo Directivo
2018-2020
- Presidente: Dr. Pedro Luis Valverde
- Vicepresidente: Dr. Carlos Fabián Vargas Mendoza
- Tesorero: M.C. Fernando Vite González
- Secretario: Biol. Gilberto Hernández Cárdenas
Consejo Directivo
2016-2018
- Presidenta: Dra. Valeria Souza, Instituto de Ecología, UNAM
- Vicepresidente: Dr. Luis Eguiarte. Instituto de Ecología, UNAM
- Tesorera: Dra. Erika Aguirre Planter. Instituto de Ecología, UNAM
- Secretario: Dr. Felipe García Oliva IIES – UNAM
- Secretaria: Dra. Laura Espinoza Asuar. UNAM
Presidencias regionales 2016-2018
| Dra. Angelina Martínez Yrizar | Noroeste | Intituto de Eecología – UNAM Unidad Hermosillo |
| Dr. José Guadalupe Martínez Ávalos | Noreste | UAT |
| Dra. Elisabeth Huber-Sannwald | Mesa Central | IPICyT |
| Dr. José Luis Navarrete Heredia | Occidente | CUCBA – UdeG |
| Dr. Jordan Golubov Figueroa | Centro | UAM – X |
| Dr. Humberto Hernández Trejo | Oriente | UJAT |
| Dr. Neptalí Ramírez Marcial | Sur | ECOSUR |
| Dr. Juan Manuel Dupuy Rada | Península de Yucatán | CICY |
Consejo Directivo
2014-2016
- Presidente: Dr. Miguel Martínez Ramos. IIES – UNAM
- Vicepresidente: Ek del Val de Gortari, IIES-UNAM
- Tesorero: Dr. Leonel A. López-Toledo, UMSNH
- Secretaria: Dra. Ireri Suazo Ortuño, UMSNH
- Secretaria: Dra. Teresa Valverde Valdés
Presidencias regionales 2014-2016
| Dra. Angelina Martínez Yrizar | Noroeste | Intituto de Eecología – UNAM Unidad Hermosillo |
| Dr. José Guadalupe Martínez Ávalos | Noreste | UAT |
| Dra. Elisabeth Huber-Sannwald | Mesa Central | IPICyT |
| Dr. José Luis Navarrete Heredia | Occidente | CUCBA – UdeG |
| Dr. Jordan Golubov Figueroa | Centro | UAM – X |
| Dr. Humberto Hernández Trejo | Oriente | UJAT |
| Dr. Neptalí Ramírez Marcial | Sur | ECOSUR |
| Dr. Juan Manuel Dupuy Rada | Península de Yucatán | CICY |
Consejo Directivo
2012-2014
- Presidente: Jorge López-Portillo
- Vicepresidente: Victor Parra Tabla
- Secretario: Robert Manson
- Secretario: Ma. Luisa Martínez
- Tesorera: Ana Laura Lara
Consejo Directivo
2010-2012
- Presidente: Ken Oyama Nakagawa
- Vicepresidente: Mauricio Quesada Avendaño
- Secretario: Demián Hinojosa Garro
- Secretaria: Marcela Osorio
- Tesorera: Ek del Val de Gortari
Consejo Directivo
2008-2010
- Presidente: Juan Nuñez Farfán
- Vicepresidente: Arturo Flores Martínez
- Secretaria: Graciela García Guzmán
- Secretario: Néstor Mariano Bonigo
- Tesorero: Zenón Cano Santana
Consejo Directivo
2006-2008
- Presidente: Juan Nuñez Farfán
- Vicepresidente: Arturo Flores Martínez
- Secretario: Pedro Luis Valverde Padilla
- Secretario: Néstor Mariano Bonigo
- Tesorero: Zenón Cano Santana